學校創建于1934年，初名惠世高級護校。幾經更名于1986年改為泉州衛生學校。2004年5月經國家教育部批準升格為泉州醫學高等專科學校。2008年國家教育部高職高專院校人才培養工作水平評估獲優秀等級；2009年被確定為福建省示范性高等職業院校；2014年通過國家骨干高職院校項目驗收，成為全國第三所、福建省唯一一所國家示范性（骨干）醫藥衛生類高職院校;2015年順利通過高等職業院校第二輪人才培養工作評估；2020年成為福建省示范性現代高等職業院校。