南通大學杏林學院是經國家教育部批準成立的本科層次獨立學院。學院始建于1999年2月，前身為南通醫學院杏林學院，2004年5月在原南通醫學院、南通工學院和南通師范學院合并組建南通大學后，更名為南通大學杏林學院。