河北省微生物多樣性研究與應用實驗室的前身是河北大學微生物學研究所。2006年1月順利通過了河北省科技廳、省財政廳、省發展和改革委員會組織的專家組驗收，納入河北省重點實驗管理序列。實驗室第一任主任為張利平教授，第一屆學術委員會主任為魏江春院士。經過30多年的建設與積累，本實驗室在放線菌系統生物學、粘細菌、海洋放線菌、微生物遺傳育種、微生物新穎結構的天然產物篩選、發酵工程研究等方面已形成優勢和特色；在基因和蛋白質系統發育信息分析、蛋白質芯片為主要研究內容的生物信息學的研究方面業已形成初步規模，形成了從各類微生物物種分離、分類、保育；活性產物的篩選至發酵工藝路線建立的微生物資源開發的技術體系。
實驗室固定人員共由26人組成，其中學術隊伍23人，技術人員3人。固定人員中教授12人，副教授（高級實驗師）9人，講師5人。
實驗室使用面積1500m2，儀器設備450余臺套，設備總值2000余萬元。其中基因槍、 基因芯片點樣儀和基因芯片掃描儀、蛋白液相、紫外可見分光光度計、高效液相色譜儀、全自動發酵罐、PCR儀等多臺先進儀器，達到該研究領域國內先進水平。
近年來，實驗室承擔了包括國家自然科學基金重大項目、面上項目、科技部自然科技資源平臺建設項目、國家計委攻關課題等在內的省部級以上課題30余項，在國內外重要學術刊物上發表論文200余篇，其中被SCI收錄20余篇，已鑒定成果15項，獲省部級科技進步獎6項，“利用酵母菌發酵制備木糖醇的方法”獲國家授權發明專利。
