藥物基因和蛋白篩選國家工程實驗室于2008年7月批準建設，實驗室建有基因與蛋白表達檢測、基因文庫與肽庫、中藥化學成分、篩選模型、基因與蛋白鑒定、中藥成分鑒定、藥物活性體外檢測、動物轉基因等研發平臺。
以系統生物學、功能基因組學、轉錄組學、蛋白組學的理論與技術研究為基礎，開展以成藥基因和成藥蛋白篩選為核心的藥物篩選工作，主要著眼于以成藥基因和成藥蛋白作為進一步開展中藥有效成分篩選的靶標，利用其建立適合于高通量篩選的藥物篩選模型，通過大規模的中藥化學成分樣品庫篩選，發現能夠有效增強成藥基因表達和提高成藥蛋白活性及功能中藥有效成分，在此基礎上開發組成成分明確，作用機理清楚的現代中藥新藥。
實驗室緊密圍繞重大疾病防治的需要，不斷提高基因工程和蛋白藥物創新領域的自主創新能力，積極完成國家有關部門委托的科研課題，開展相關產業關鍵技術攻關、重要技術標準研究制定，凝聚、培養產業急需的技術創新人才。
