“分子構效關系湖南省普通高等學校重點實驗室”（以下簡稱實驗室）依托湖南科技大學，以湖南省有機化學重點學科為平臺，在分子構效關系與分子模擬實驗室、性能檢測與結構分析實驗室及現代合成與分離實驗室的基礎上，于2004年12月獲準組建。
實驗室實行主任負責制，由化學化工學院院長易平貴教授任主任；成立了由15名本學科領域專家組成的實驗室學術委員會，其中校外專家9人，學術委員會主任由國務院學位委員會學科評議組（化學）成員、武漢大學博士生導師秦金貴教授擔任，湖南科技大學副校長曹晨忠教授擔任學術委員會副主任。
經過近4年的建設與發展，實驗室現有固定研究人員39人，其中教授20人，副高級職稱人員11人，具有博士學位的25人，分屬有機化學、物理化學、應用化學、無機化學、分析化學、材料科學、環境化學、農藥學等學科；形成了定量結構-性能/活性相關，生物活性物質的合成、分子模擬與篩選，功能材料的合成與結構效應等3個具有一定特色的研究方向。
建設期間，實驗室新增科研項目64項，其中國家級項目11項，省部級項目26項，累計科研經費達1102萬元。實驗室研究人員獲省部級獎3項，轉讓成果10項，申請國家專利20項并已授權8項，出版專著3部、教材3部，在國內外重要學術刊物上發表學術論文230多篇（其中被SCI、EI收錄100余篇，SCI引證200余次）。
實驗室積極開展學術交流活動，2007年承辦了國家自然科學基金委化學科學部主辦的物理有機化學學術與發展研討會，2008年舉辦了湖南省化學化工學會有機化學春季學術報告會，參加國際和國內學術會議43人次，邀請國內外專家短期訪問講學共40人次，派遣學術骨干到國外大學訪問、合作和學術交流2人次。
實驗室工作條件得到了較大的改善，新增儀器設備費1229.1萬元，其中包括500兆超導核磁共振儀、X-射線單晶衍射儀等一批先進儀器設備，目前設備總值已達2672.1萬元，其中共有5萬元以上儀器設備34臺套。擁有專業圖書資料達13000余冊，訂購了多種國際重要學術期刊，購置了ACS、Elsvier 等國際專業電子期刊和數據庫。
在“分子構效關系湖南省高校重點實驗室”的基礎上，組織申報了“理論化學與分子模擬省部共建教育部重點實驗室”，并已被教育廳推薦上報到教育部。
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