南京審計學院公共工程審計實驗室是江蘇省重點實驗室（以下簡稱“實驗室”）。它以南京審計學院審計學專業和工程管理專業為依托，由在2002年成立的固定資產投資審計實驗室基礎上發展演變而成。
機構設置
實驗室設主任1名，副主任1名。實驗室人員由專職研究人員、兼職研究人員、專職技術人員和管理人員組成；實驗室下設三個工作室和一個辦公室，三個工作室分別是公共工程審計基礎理論與方法研究工作室、公共工程質量測度與審計研究工作室、模擬教學與案例開發研究工作室。
實驗室設立實驗室學術委員會。學術委員會是實驗室的學術指導機構，負責重點實驗室的學術決策和評審重點實驗室的發展目標、研究方向、申報研究課題、組織成果評價、討論和審議實驗室的經費計劃和重大學術活動。
科研功能
為充分發揮科研平臺的作用，促進科研合作與學術交流，實驗室本著“開放、流動、合作、創新”的運行機制設立開放課題，支持與實驗室主要研究方向相關的基礎研究和應用基礎研究項目，并鼓勵交叉研究。重點研究領域涉及以下三個方面：第一，公共工程審計理論與方法創新研究；第二，公共工程審計關鍵技術研究；第三，公共工程質量測度與審計研究。
教學功能
以我國大型公共工程建設和審計需求為主要導向，實驗室教學實驗研究重點涉及公共工程審計模擬實驗研究、管理信息系統開發、仿真模擬技術研究與開發等相關方面，以達到培養高質量工程審計人才的目標。
實驗室利用中央地方共建資金建設土木工程實驗室、工程質量審計體驗場、室外工程審計模型、造價審計沙盤、基建財務審計沙盤等，并配備與之相適應的電子仿真模擬系統，以滿足固定資產投資審計教學與培訓需要，幫助學生學員增強對工程的感性認識，實現從平面圖紙到三維立體的轉化，并在此基礎上提高計算工程量、套用定額、編制與審計工程造價能力，以達到理解工程建設與管理技術、掌握工程審計技術的基本目標。
發展宗旨
實驗室集科學實驗、教學實驗和人才培養三大功能于一體，密切關注國際發展前沿，擬通過跨學科研究，發揮多學科、多技術、多方法論綜合集成優勢，探索具有全面性、綜合性、系統性、創新性和預測性的工程審計基礎理論和方法，致力于探討和研究我國公共工程審計領域的重大理論與實踐問題，促進新興和交叉學科的形成與發展，為我國公共工程審計實踐提供理論支撐和先進技術工具，培養和造就高層次人才，對轉軌時期工程審計實踐形成理論和方法上的支撐，服務于國家經濟建設和審計事業發展。
