“農業部東海海水健康養殖重點實驗室”（以下簡稱“實驗室”）依托于集美大學，是農業部根據“農業部重點實驗室發展規劃（2010-2015）”，于2011年7月正式批準設立的一個專業性（區域性）重點實驗室（批準文號為：農科教發[2011]8號）。
本實驗室將圍繞我國東海區海水養殖業健康可持續發展涉及的重大關鍵問題，從種質資源與遺傳改良、養殖新技術新模式研發與應用、主要疫病防控、營養與飼料、養殖水環境調控與修復等方面開展研究工作，解決產業發展中存在的應用基礎與共性技術問題，建立高水準的研究平臺，聚集和培養優秀研發人才，促進對外和對臺合作與交流，為產業的良好和持續發展提供技術支撐。
實驗室現有固定人員45人，其中正高級職稱20人（其中博導5人），副教授17人，中級職稱8人；其中，34人具有博士學位，7人具有碩士學位。現有實驗室用房總面積約6000m2，儀器設備總值3445.1萬元。實驗室采用學術委員會指導下的主任負責制的運行機制，經農業部批準，由我國著名魚類養殖學專家、中國水產科學研究院黃海研究所雷霽霖院士擔任本實驗室學術委員會主任委員，我國著名海洋生物技術學家、國家海洋局第三海洋研究所徐洵院士和我國著名水產飼料與營養學家、中國海洋大學麥康森院士任副主任委員；由我院水產養殖學學科帶頭人、全國水產原種和良種審定委員會委員、博士生導師王志勇教授擔任實驗室主任，水產養殖學學科學術帶頭人姚翠鸞教授和水產病害防治學科帶頭人鄢慶枇教授擔任副主任。實驗室現有在研各級各類科研項目超過50項，其中有國家863計劃項目4項、973計劃前期專項1項、國家支撐計劃項目2項、公益性行業科研專項5項、國家自然科學基金項目13項；年度科研經費合計1300多萬元。
