伊犁師范學院新疆哈薩克文化與民族現代化研究中心的前身是成立于2007年5月的伊犁師范學院哈薩克文化研究所。1996年3月經伊犁師范學院黨委研究決定，將隸屬學院科研處的哈薩克文化研究室更名為“哈薩克文化研究所”，并移交中文系（現人文學院）進行日常管理，采取兩個牌子一套班子的管理方式，由時任中文系副主任的著名哈薩克族詩人、學者杜坦擔任首任所長。研究所下設6個研究組，分別是文學研究組、語言研究組、中學語文教學研究組、哈薩克民俗及醫學研究組、歷史研究組、音樂研究組。經過長期的發展建設，哈薩克文化研究所匯聚了一批熱心于哈薩克文化研究的各民族學者，取得了一批在國內產生較大影響的學術成果，為弘揚哈薩克民族文化、促進哈薩克民族的現代化進程作出了重要貢獻。
2007年5月，經新疆維吾爾自治區編委批準，哈薩克文化研究所正式成為伊犁師范學院一個獨立運行的科研實體，由哈薩克族學者烏魯木齊拜教授擔任研究所所長。
2010年10月，為加快伊犁師范學院辦學轉型和結構調整步伐，努力實現“立足地方、服務地方”新的辦學定位，更好地適應區域經濟社會發展的需要，加快提升為區域新型工業化、農牧業現代化、新型城鎮化、社會事業發展整體服務的能力，為“十二五”發展奠定良好的基礎，伊犁師范學院對理工學科、人文社會學科、師范教育學科重新整合，確立了五大重點建設發展的項目。其中，根據哈薩克文化研究所科學研究的歷史基礎，充分考慮區域社會事業發展的形勢和學院本身的辦學定位，充分發揮學院人文社會科學學科在區域發展中的文化傳承、創新和引領作用，將哈薩克文化研究所研究方向及相關資源重新調整配置，組建成新疆哈薩克文化與民族現代化研究中心，下設哈薩克語言文學與民族現代化研究室、哈薩克族公民社會教育與民族現代化研究室、哈薩克族音樂藝術與民族現代化研究室三個子機構。
