《數碼暗房酷炫特效創意》《VR探秘夢幻空間》《探秘酷炫的DOTA機器人》……6個二級學院精心準備的選修課基本上涵蓋了貫通學生不同的個性特長發展的需求，切合了青少年的學習興趣和關注熱點，滿足了他們自主發展的愿望。由于學生們所選的課程大多是自己喜愛的，所以孩子們在創新課上的表現極其專注，全新的教學模式和精彩的課程內容，讓學生們重拾學習探索的興趣和熱情。
創新的課程設置方式，讓考核方式必然發生變化。據汽車工程學院王楠老師介紹，選修他所教授的《電動小車DIY》這門課程的學生，來自學校貫通項目15、16級兩個年級的各個班級，同學們先進行15周的理論課程學習，了解基本的原理和知識，最后一周再進行創新課程實踐，親自動手完成一輛3D小車作品作為課程考核。“創新課程完全沒有紙質的考試，學生動手進行科技實踐完成課程，”王楠老師表示，“創新課程的設置能激發學生對科學的興趣，培養學生的創新精神和動手能力，引導他們自主探索與交流的能力，也為貫通項目的學生以后選擇專業、畢業就業打下基礎。”
面向創意、面向制作、面向競賽，面向發明，創新課程不僅集聚了校內外創新要素與優質資源，更以校企合作為路徑，積極走出去，開闊學生的眼界。創新課程的實踐活動不是局限于最后一周的課程時間，在平常的教學當中，也在積極與企業實踐相結合，走出學校進行聯合教學活動：選修《玩轉大數據時代的智慧供應鏈》的同學來到招商局物流集團北京有限公司，進行圍繞供應鏈實際作業的一系列實操接觸活動；選修《藝術家3D立體手制書體驗》的同學們來到“敬人紙語”藝術工作坊，了解了一本書是如何從設計稿變成為精美的成品，并親手縫制了屬于自己的手工書；電信學院《北斗-導航智慧生活》的課堂搬到了中科院光電研究院北斗科研基地，同學們可以近距離聆聽中科院研究員的講座，體驗飛艇的制作過程。
貫通項目創新課程的開展，極大地促進了學生們對于知識學習和探究的興趣。興趣是最好的老師，創新課程必將給貫通項目的教學帶來嶄新的氣象，讓校園的學習生活變得更加生動而多彩。
